Dentro de las funciones de la Dirección de Planeación e Instrumentación están las siguientes:
- Coordina procesos de planeación como la formulación de los Planes de Desarrollo.
- Coordina el proceso de formulación y validación de los POA de todas las dependencias de la Universidad.
- Coordina el análisis de prefactibilidad y pertinencia de la Nueva Oferta Educativa.
- Coordina la formulación de las propuestas de los diferentes fondos extraordinarios como PROEXEES, PADES e Inclusión.
- Brinda asesoría y acompañamiento en la formulación de distintos proyectos para obtener recursos.
- Coordina las actividades de la COD-COEPES.
- Gestiona la validación de las transferencias de recursos ante Secretaría de Planeación y Secretaría de Hacienda.
- Participa en el análisis de la organización académica y administrativa.
- Participa la formulación de manuales de organización, funciones y puestos.